吕东升撰文认为，推进社会主义新农村建设是一个庞大的社会系统工程。从指导思想和理论层面上看，正确把握和处理好以下几个关系至关重要。（1）推进社会主义新农村建设与城镇化的关系。当前处理两者关系，关键是要打破城乡二元结构，大力推进“五个一体化”：一是推进城乡发展规划一体化。要按照建立工业反哺农业、城市支援农村新体制要求打破分割格局，高标准、高起点地编制城乡一体化发展规划。二是推进产业布局一体化。三是推进城乡基础设施建设一体化。四是推进城乡社会事业发展一体化。五是推进城乡政策一体化。（2）政府主导作用与市场机制作用的关系。（3）经济发展与其他要件的关系。生产力的发展是新农村建设的首要任务，但是，发展是全面的发展。发展又是一个系统工程，受诸多要素制约，因此新农村建设必须作为系统工程来抓。（4）当前发展与长远发展的关系。当前，有必要解决好以下三个问题：一是要教育和引导基层干部群众树立艰苦创业、长期奋斗的思想，处理好当前与长远的利益关系；二是要坚持把解决农民群众最关心、最迫切的问题作为切入点；三是要建立适应新农村建设需要的干部人事工作新机制。